1、加熱介質：使用蒸餾水和去離子水，這將防止在水浴壁上產生水垢。注意不要使用有機溶劑作加熱介質。

2、換水：水浴中的水建議一周一換，長不超過一月。

3、除藻劑：不加熱時，在水浴的水中加以除藻劑，可防止生物污染。

4、針頭：每次使用完針后都應清洗，盡量減少針的污染。

5、機體：水浴加熱器底部底耐水但不防水。

6、酸性環境：當接觸或暴露于酸性材料、蒸汽或樣品后，應當立刻清洗。